Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX1P78414 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX1P78414 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX1P78414 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX1P78414 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX1P78414 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX1P78414 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX1P78414 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX1P78414 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX1P78414 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX1P78414 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRX1P78414 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRX1P78414 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRX1P78414 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRX1P78414 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRX1P78414 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRX1P78414 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRX1P78414 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRX1P78414 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRX1P78414 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRX1P78414 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRX1P78414 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRX1P78414 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
IRX1P78414 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRX1P78414 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms