Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A1P68400 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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