Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
RPS29P62273 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
RPS29P62273 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
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