Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX16P57768 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX16P57768 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX16P57768 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX16P57768 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX16P57768 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX16P57768 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX16P57768 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX16P57768 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX16P57768 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX16P57768 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX16P57768 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX16P57768 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX16P57768 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX16P57768 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX16P57768 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX16P57768 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX16P57768 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms