Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BACE1P56817 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BACE1P56817 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BACE1P56817 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms