Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERFP50548 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERFP50548 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERFP50548 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERFP50548 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERFP50548 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERFP50548 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ERFP50548 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERFP50548 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERFP50548 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERFP50548 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERFP50548 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERFP50548 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERFP50548 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERFP50548 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERFP50548 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERFP50548 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERFP50548 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERFP50548 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERFP50548 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERFP50548 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERFP50548 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERFP50548 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERFP50548 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERFP50548 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ERFP50548 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ERFP50548 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ERFP50548 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERFP50548 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERFP50548 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms