Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms