Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTDSS1P48651 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms