Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms