Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KDM5CP41229 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5CP41229 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms