Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms