Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
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