Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLD1P28340 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
POLD1P28340 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
POLD1P28340 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLD1P28340 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLD1P28340 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLD1P28340 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLD1P28340 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLD1P28340 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLD1P28340 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLD1P28340 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLD1P28340 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLD1P28340 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLD1P28340 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLD1P28340 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLD1P28340 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLD1P28340 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLD1P28340 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLD1P28340 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
POLD1P28340 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
POLD1P28340 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
POLD1P28340 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLD1P28340 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLD1P28340 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLD1P28340 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLD1P28340 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms