Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMBRP28336 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NMBRP28336 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NMBRP28336 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NMBRP28336 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NMBRP28336 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMBRP28336 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMBRP28336 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMBRP28336 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMBRP28336 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMBRP28336 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMBRP28336 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMBRP28336 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMBRP28336 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMBRP28336 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMBRP28336 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMBRP28336 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMBRP28336 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMBRP28336 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMBRP28336 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMBRP28336 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMBRP28336 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMBRP28336 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMBRP28336 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMBRP28336 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMBRP28336 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMBRP28336 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMBRP28336 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NMBRP28336 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMBRP28336 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NMBRP28336 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMBRP28336 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms