Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA1P20827 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms