Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PTPRAP18433 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PTPRAP18433 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PTPRAP18433 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PTPRAP18433 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PTPRAP18433 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PTPRAP18433 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRAP18433 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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