Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPI1P17947 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPI1P17947 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPI1P17947 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPI1P17947 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPI1P17947 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPI1P17947 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPI1P17947 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPI1P17947 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPI1P17947 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPI1P17947 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPI1P17947 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPI1P17947 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPI1P17947 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SPI1P17947 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPI1P17947 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPI1P17947 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPI1P17947 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPI1P17947 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPI1P17947 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPI1P17947 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPI1P17947 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPI1P17947 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPI1P17947 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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