Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EPB42P16452 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPB42P16452 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPB42P16452 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPB42P16452 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPB42P16452 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPB42P16452 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPB42P16452 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPB42P16452 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPB42P16452 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPB42P16452 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPB42P16452 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPB42P16452 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPB42P16452 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPB42P16452 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPB42P16452 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPB42P16452 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPB42P16452 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPB42P16452 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPB42P16452 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPB42P16452 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPB42P16452 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPB42P16452 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPB42P16452 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPB42P16452 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPB42P16452 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPB42P16452 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPB42P16452 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EPB42P16452 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPB42P16452 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPB42P16452 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPB42P16452 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPB42P16452 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPB42P16452 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPB42P16452 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPB42P16452 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPB42P16452 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPB42P16452 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPB42P16452 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPB42P16452 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPB42P16452 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPB42P16452 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPB42P16452 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPB42P16452 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPB42P16452 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPB42P16452 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPB42P16452 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPB42P16452 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPB42P16452 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPB42P16452 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPB42P16452 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms