Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms