Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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PTPRCP08575 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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PTPRCP08575 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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PTPRCP08575 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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PTPRCP08575 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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PTPRCP08575 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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PTPRCP08575 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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PTPRCP08575 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRCP08575 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
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