Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRPRAP08240 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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