Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRT6BP04259 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms