Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VIPP01282 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VIPP01282 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VIPP01282 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VIPP01282 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms