Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLXNC1O60486 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNC1O60486 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms