Protein–RNA interactions for Protein: O60294

LCMT2, tRNA wybutosine-synthesizing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCMT2O60294 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCMT2O60294 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCMT2O60294 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCMT2O60294 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LCMT2O60294 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCMT2O60294 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms