Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EDIL3O43854 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms