Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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HOXA3O43365 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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