Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXA2O43364 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXA2O43364 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms