Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms