Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP290O15078 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP290O15078 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP290O15078 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP290O15078 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP290O15078 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP290O15078 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP290O15078 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP290O15078 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP290O15078 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP290O15078 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP290O15078 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP290O15078 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP290O15078 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP290O15078 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP290O15078 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP290O15078 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP290O15078 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP290O15078 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP290O15078 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP290O15078 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP290O15078 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP290O15078 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP290O15078 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP290O15078 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP290O15078 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP290O15078 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP290O15078 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP290O15078 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP290O15078 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP290O15078 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP290O15078 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP290O15078 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP290O15078 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP290O15078 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP290O15078 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP290O15078 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP290O15078 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP290O15078 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP290O15078 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP290O15078 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP290O15078 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP290O15078 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP290O15078 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP290O15078 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP290O15078 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP290O15078 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP290O15078 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP290O15078 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP290O15078 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP290O15078 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP290O15078 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP290O15078 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP290O15078 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP290O15078 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP290O15078 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP290O15078 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP290O15078 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP290O15078 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP290O15078 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP290O15078 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP290O15078 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP290O15078 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP290O15078 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP290O15078 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP290O15078 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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CEP290O15078 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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CEP290O15078 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP290O15078 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP290O15078 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP290O15078 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP290O15078 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP290O15078 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP290O15078 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP290O15078 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP290O15078 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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