Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EBAG9O00559 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBAG9O00559 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms