Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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