Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf172C9J069 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms