Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B4E171 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
B4E171 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms