Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

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Length 811 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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ZNF839A8K0R7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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ZNF839A8K0R7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF839A8K0R7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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