Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms