Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EME2A4GXA9 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms