Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms