Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms