Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLCO3A1Q9UIG8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms