Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK3Q9UBP4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms