Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms