Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TBCCD1Q9NVR7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms