Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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