Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX15Q9NRS6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms