Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A20Q9NP91 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC6A20Q9NP91 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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