Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAT0

ROPN1, Ropporin-1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1Q9HAT0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROPN1Q9HAT0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms