Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCSER1Q9C0I3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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