Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM54Q9BYV2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM54Q9BYV2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms