Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms